Набор для секвенирования ДНК с лигированием, Ligation Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-LSK109

Предлагаем к покупке Набор для секвенирования ДНК с лигированием, Ligation Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-LSK109. На рынке медицинского оборудования компания ЛидерМед Групп уже более 10 лет! С нами сотрудничают как крупные государственные учреждения, так и частные международные клиники. Среди наших поставщиков ведущие производители медоборудования с многолетней историей, опытом и надежной репутацией. Вся продукция лицензирована и сертифицирована в соответствии с установленными требованиями.

Набор предназначен для секвенирования двухцепочечной ДНК. Это наиболее универсальный набор из всех, предлагаемых Oxford Nanopore Technologies. С помощью набораLigation Sequencing Kitможно:

• получить максимальную производительность секвенирования;
• контролировать длину секвенируемых фрагментов.

Для данного набора предлагается множество протоколов пробоподготовки библиотек из различного исходного материала (геномная ДНК, плазмидная ДНК, ампликоны) и для различных задач (геномное секвенированиеde novo, ресеквенирование, таргетное секвенирование, мультиплексное секвенирование и т.д.). Процесс пробоподготовки заключается в достройке концов ДНК, пришивке 3’-концевой dA и лигировании к ней адаптеров.
Особенности набора

время пробоподготовки	60 минут
требуемое количество ДНК	1000 нг двухцепочечной ДНК
необходимость ПЦР	нет
фрагментация ДНК	опциональная, рекомендуется при количестве исходной ДНК менее 500 нг
длина рида	зависит от длины исходных фрагментов
производительность	2 гигабазы и более за 6 часов, 8 гигабаз и более за 48 часов
совместимые протоколы	Ligation Sequencing; Premium whole genome amplification; Sequence capture *
количество библиотек	6
совместимость с проточными ячейками	FLO-MIN106D; FLO-MIN107

* Полные протоколы доступны на сайтеwww.nanoporetech.comдля зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор оптимизирован для высокопроизводительного секвенирования. Для максимальной производительности рекомендуется получать библиотеку из 100-200 фмоль высокомолекулярной ДНК. Также важна степень чистоты ДНК, загрязнения существенно снижают производительность. Рекомендуется использоватьнаноспектрофотометрдля оценки степени чистоты ДНК по следующим критериям:

• A260/A280 = 1,8;
• А260/А230 = 2 - 2,2.

Можно секвенировать библиотеки, полученные с помощьюLigation Sequencing Kitиз меньшего количества ДНК или ДНК низкого качества, но это существенно уменьшает производительность секвенирования. Частично можно улучшить библиотеку с помощью стадии ПЦР: происходит обогащение библиотеки при малом стартовом количестве ДНК, а также снижается влияние примесей за счёт разведения образца. Но, если ПЦР является неотъемлемой частью пробоподготовки, рекомендуется использоватьPCR Sequencing KitилиRapid PCR Barcoding Kit.
Аналогично, если планируется регулярно секвенировать ампликоны или кДНК, рекомендуется использовать соответствующие наборы —PCR Sequencing Kitили, для секвенирования кДНК,cDNA-PCR Sequencing KitиDirect cDNA Sequencing Kit.
НаборLigation Sequencing Kitможет быть использован для мультиплексного секвенирования. Для этого необходимы дополнительные наборыNative Barcoding Expansion 1-12и13-24(для мультиплексирования без стадии ПЦР) илиPCR Barcoding Expansion 1-12и1-96(для мультиплексирования со стадией ПЦР).
Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• магнитные частицыAgencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНКNEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
• ДНК-лигазаNEBNext Quick Ligation Module (New England Biolabs E6056);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностьюDNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (AxygenPCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher ScientificR0581);
• свежеприготовленный 70% этанол.

Опционально:

• набор для репарации ДНКNEBNext FFPE Repair Mix (New England BiolabsM6630);
• пробирки для фрагментации ДНКCovaris g-TUBE.

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например,Eppendorf5452000018);
• вортекс (например,BiosanBS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм3336);
• ротационный перемешиватель (например,ElmiRM1L);
• амплификатор (например,Thermo Fisher ScientificA37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например,Eppendorf3120000020), от 2 до 20 мкл (например,Eppendorf3120000038), от 10 до 100 мкл (например,Eppendorf3120000046), от 20 до 200 мкл (например,Eppendorf3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например,Eppendorf3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS).

Опционально:

• флуориметрQubit 4.0(ThermoQ33227);
• система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например,NanoDrop 2000C);
• система для препаративного электрофорезаBluePippin.

Вы можете купить Набор для секвенирования ДНК с лигированием, Ligation Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-LSK109 уже сегодня, связавшись с персональным менеджером по указанному номеру телефона или через почту. Вас обязательно проконсультируют по любым выбранным товарным позициям и помогут подобрать оптимальный вариант. Также рады сообщить, что доставка осуществляется по территории всей России и ближнего зарубежья. При необходимости опционально доступна поставка и установка дополнительного оборудования. После покупки предоставляется сервисное и гарантийное обслуживания.

Array